Ces instances réfléchissent aux actions à conduire et élaborent des propositions pour le Conseil d’Administration :

• La Commission Nationale des Agricultrices : elle représente les agricultrices, défend et fait reconnaître leurs droits. Elle vise à l’égalité professionnelle entre hommes et femmes.
• La Section Nationale des Fermiers et de Métayers ;
• La Section Nationale des Propriétaires Ruraux ;
  Ces deux sections œuvrent pour améliorer et facilité la mise à bail des terres agricoles aux exploitants agricoles.
• La Section Nationale des Anciens Exploitants : elle s’attache à défendre les intérêts des retraités agricoles (accès aux soins, montant des retraites, conditions de vie…).

Mais également de nombreuses commissions thématiques permanentes : agriculture biologique, territoires, environnement, fiscale et sociale, montagne et zones défavorisées, viticulture, apiculture, économie, emploi, formation, etc.